İki ana caddenin şehrin tam ortada kesiştiği yerde İznik'in en eski dini yapısı yer almaktadır. İsa'nın vasıflarından biri olan "Kutsal BilgeIik"e adanmış olan kilise, özellikle 787de gerçekleşen Vll. Ökümenik Konsil'in toplandığı mekan olarak tarihi bir önem taşır. Her ne kadar bu tarihten önce hiç bir kaynak kiliseden söz etmese de, merkezi konumu ve orijinal planı, binanın V. yüzyıl sonları veya VI. yüzyıl başlarında yapıldığını göstermektedir. Orijinal kilise sütunlarla üç nefe ayrılmış bazilikal bir plana sahipti. Bu plan İstanbul'da V. yüzyılda yapılmış olan İmrahor Camii (Studios manastırının aziz loannes kilisesi) ve Acem Ağa mescidi (Meryem-Theotokos Khalkoprateia kilisesi) diye bilinen eski Bizans kiliseleri ile büyük benzerlik gösterir.