(1856 Manchester, İngiltere - 1940 Cambridge, İngiltere) İngiliz fizikçi. Joseph John Thomson, 18 Aralık 1856 tarihinde Manchester'da doğdu. Henüz 14 yaşındayken, şimdiki adı Manchester Victoria Üniversitesi olan Owens Kolejine başladı. Buradaki matematik hocası ona Cambridge'deki en prestijli kolejlerden biri olan Trinity Kolejine burs için başvurmasını önerdi. Bursu kazanarak Trinity'ye giden Thomson, 1880 yılında yine ünlü bir fizikçi olan Joseph Larmor'ın ardından ikincilikle okulu bitirdi. Trinity Kolejinin isteğiyle orada kalan Thomson, sonradan elektromanyetik kuvvetler ve atomun yapısını anlamakta kendisine önemli ipuçları verecek olan matematiksel modeller üzerinde çalışmaya başladı. Thomson ünlü Cavendish Lâboratuvarına, Maxwell ve Lort Rayleigh'den sonra seçilen üçüncü profesör oldu ve bu onun hayatındaki en önemli dönüm noktalarından biri oldu. Onu ünlü yapacak keşfini de buradaki çalışmalar sırasında yaptı.

Thomson, katot ışın tüpüyle elektronu buldu. Elektronun kütlesini ve yükünü hesaplayarak, kendi adını taşıyan Thomson atom modelini geliştirdi. 13 kitap ve 200 kadar makale yazan Thomson, elektronu bularak "çağdaş atom fiziğinin kurucusu" unvanını kazandı.

Thomson, elektronu keşfinden sonra, sayısız ödülle onurlandırıldı ve fiziğe yaptığı katkılarla, fizik tarihindeki büyük bilim adamları arasında yerini aldı. 1906 yılında da, gazlardaki yük boşalımı üzerine yaptığı araştırmaları nedeniyle, Nobel Fizik Ödülü'nü aldı.